Система для высокопроизводительного секвенирования ДНК в комплекте Ion Personal Genome Mashine

НазваниеСистема для высокопроизводительного секвенирования ДНК в комплекте Ion Personal Genome Mashine
Описание

Назначение прибора:

-              Секвенирование генов человека, животных, растений (от одного до сотен и тысяч генов);

-              Целевое секвенирование участков генома любого организма;

-              Поиск соматических и наследственных мутаций;

-              Полное повторное секвенирование геномов бактерий, вирусов и грибов (поиск SNP, структурных перестроек и вариаций копийности, полногеномное генотипирование);

-              Секвенирование транскриптома (для небольших геномов).

Области применения:

Применяется в фундаментально-научных исследованиях (заболевания человека и животных, эпигеномные и метагеномные исследования, исследования древней ДНК и др.).

Требования к образцам исследования:

Очищенные нуклеиновые кислоты с концентрацией от 10 нг/мкл (концентрация и объём образца зависят от типа исследования).

По ссылке можно ознакомиться с информацией по различным расходным материалам для секвенатора:  http://helicon.ru/catalog/new-section.php?IBLOCK_ID=16&SECTION_ID=2283

Основные технические характеристики:

Виды микрочипов

Ion 314 v2, Ion 316 v2, Ion 318 v2

Производительность за прогон, пар нуклеотидов (при длине прочтения 400 п.н.)

чип 314 v2: 60-100 Мб; чип 316 v2: 600 Мб - 1 Гб; чип 318 v2: до 1.2-2 Гб

Длина прочтения, пар нуклеотидов

задается пользователем в диапазоне 25-400 п.н.

Время секвенирования (при длине прочтения 400 п.н.)

чип 314 v2 - 3,7 ч; чип 316 v2 - 4,9 ч; чип 318 v2 - 7,3 ч

Количество прочтений за прогон (число ридов)

чип 314 v2 400-550 тыс; чип 316 v2 2-3 млн; чип 318 v2 4-5,5 млн

Ion Torrent сервер

два шестиядерных процессора, 48 Гб RAM, восемь дисков объемом по 2 Тб (RAID 5)

Форматы выходных данных

BAM, FASTQ, SFF, VCF

Число образцов, одновременно секвенируемых за 1 запуск прибора

1-384 с использованием технологии штрих-кодирования

Размеры, мм

610 х 510 х 530

Вес, кг

30

Требуемая мощность сети

max 9 A

 

Фирма-изготовительIon Torren
Страна-изготовительСША
Год выпуска2013